Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NEDD8Q15843 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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