Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FRMPD4Q14CM0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms