Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GAPVD1Q14C86 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GAPVD1Q14C86 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms