Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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