Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TCIRG1Q13488 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms