Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM28Q13263 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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