Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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