Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CGNL1Q0VF96 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms