Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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