Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms