Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms