Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA3Q08378 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms