Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms