Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms