Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms