Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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