Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms