Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AIF1P55008 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AIF1P55008 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms