Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD23BP54727 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms