Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRCC3P46736 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms