Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms