Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR5P32302 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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