Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5DP30049 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms