Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRGP23470 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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