Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMPD1P23109 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms