Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms