Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms