Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms