Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1AO95602 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POLR1AO95602 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms