Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM63AO94886 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms