Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EDIL3O43854 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms