Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PHF1O43189 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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