Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms