Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-1B6SEH8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms