Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms