Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms