Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTN3Q9P232 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms