Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms