Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT82Q9NSB4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms