Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms