Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms