Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR88Q9GZN0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms