Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM31Q9BZY9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM31Q9BZY9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms