Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms