Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms