Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms