Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms