Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms