Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCSTNQ92542 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms