Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DTX3LQ8TDB6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms